La FSM a conclu un accord-cadre avec l’Institut National de Prévention et d'Education pour la Santé (INPES) en décembre 2011 pour une durée de quatre ans. Cet accord a pour objet de renforcer leur collaboration par le développement d’actions communes ou complémentaires dans le domaine de la prévention, de l’éducation pour la santé et de la promotion de la santé.