La FSM fédère 41 Conseils Nationaux Professionnels (CNP) et 5 Conseils Nationaux Professionnels associés.
CNP d'Addictologie (Fédération Française d'Addictologie)
CNP d'Allergologie
CNP d'Anatomie et Cytologie Pathologiques (CNPath)
CNP d'Anesthésie-Réanimation et Médecine péri-opératoire
CNP de Biologie des agents infectieux-Hygiène hospitalière
CNP de Biologie Médicale
CNP Cardiovasculaire
CNP de Chirurgie de l'Enfant et de l'Adolescent
CNP de Chirurgie Maxillo-Faciale, de Stomatologie et de Chirurgie Orale Médicale
CNP de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique (CNP-COT)
CNP de Chirurgie Plastique, Reconstructrice et Esthétique
CNP de Chirurgie Thoracique et Cardio-Vasculaire (CNP-CTCV)
CNP de Chirurgie Vasculaire et Endovasculaire
CNP de Chirurgie Viscérale et Digestive (CNPCVD)
CNP de Dermatologie et Vénéréologie
CNP d'Endocrinologie, Diabétologie et Nutrition
CNP de Génétique Clinique, Chromosomique et Moléculaire
CNP de Gériatrie
CNP de Gynécologie Obstétrique et Gynécologie Médicale (CNPGO et GM)
CNP d'Hématologie
CNP d'Hépato Gastro Entérologie (CNP-HGE)
CNP de Médecine Interne
CNP de Maladies Infectieuses et Tropicales
CNP de Médecine d'Urgence (Collège Français de Médecine d'Urgence)
CNP de Médecine du Sport (CNPMS)
CNP de Médecine du Travail (CNPMT)
CNP de Médecine Intensive - Réanimation
CNP de Médecine Légale et Expertises Médicales
CNP de Médecine Nucléaire
CNP de Médecine Physique et de Réadaptation (FEDMER-CNP de MPR)
CNP de Médecine Vasculaire (CNPMV)
CNP de Neurochirurgie
CNP de Neurologie (Fédération Française de Neurologie)
CNP de Néphrologie (CNP-Néphrologie)
CNP d'Oncologie
CNP d'Ophtalmologie (Académie Française de l'Ophtalmologie)
CNP d'ORL et CCF (CNP ORL)
CNP d'Orthopédie Dento-Faciale - Orthopédie Dento-Maxillo-Faciale
CNP de Pédiatrie
CNP de Pneumologie (Fédération Française de Pneumologie)
CNP de Psychiatrie
CNP de Radiologie et Imagerie Médicale (G4)
CNP de Rhumatologie
CNP de Santé Publique (CNP-SP)
CNP d'Urologie (CNPU)
CNP de Vigilance et Thérapeutique Transfusionnelles, Tissulaires et Cellulaires (CNP V3TC)
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